介绍一篇发表在Molecular Cell上的文章RAPIDASH: Tag-free enrichment of ribosome-associated proteins reveals composition dynamics in embryonic tissue, cancer cells, and macrophages，文章的通讯作者是Stanford的Maria Barna和UCSF的Davide Ruggero， 他们研究的方向分别为干细胞、胚胎发育种的转录后基因调控和癌症过程中的翻译机制。

核糖体是基因表达的直接调节因子，核糖体相关蛋白(ribosome-associated proteins, RAPs)帮助核糖体调节翻译，然而目前基于梯度离心的分离技术缺乏高度的特异性，作者实验室开发的Ribo-FLAG免疫沉淀方法又需要基因编辑，阻碍了其在广泛样本上的应用。因此作者希望开发一种通用的依赖于核糖体生物物理特性的富集技术，从而无需遗传操作和化学标记，并能高特异性地富集RAP。

本工作中，作者发现了一种可以富集rRNA从而分离细菌和酵母中活性核糖体的半胱氨酸树脂，但这一树脂的原使用方法无法维持核糖体和RAP之间的相互作用，因此作者首先在使用树脂富集前先通过超速离心方法分离了高密度的蛋白质复合物，其次优化了树脂使用的结合和洗脱盐浓度，从而在富集过程中维持了RAP与核糖体的相互作用。作者称这一方法为RAPIDASH (RAP identification by affinity to sulfhydryl-charged resin)。作者使用TMT-MS方法对富集到的蛋白质组样品进行分析，发现RAPIDASH显著富集了核糖体蛋白，并且在6次重复中至少3次重复鉴定到793种蛋白，包括一些经典的RAP如Ufl1，Ddx1等。

随后，作者将这一方法应用在发育中的小鼠前脑等组织样品上，发现了LLPH是一种新的RAP，并在神经发育和功能中起到了关键作用。对于小鼠胚胎各个组织样品的RAP鉴定则发现了在小鼠发育中发挥组织特异性作用的各类RAP。

总之，本文发展了一种基于核糖体生物物理特性富集RAP的方法，可以应用于各种不适宜遗传操作的RAP研究场景，可能对临床及组织样品的分析产生重要意义。